Яков Кротов родился 31 мая 1957 года в Москве.
В 1982 году закончил вечернее отделение Московского университета имени Ломоносова. Изучал историю христианства и десятни 1556-1622 годов. В 1974-1990-м годах работал в Исторической библиотеке, Архиве древних актов, Звенигородском музее. После этого всегда был независимым исследователем и внештатным автором различных редакций.
В 1990-2002 годах публиковал много статей в периодической печати в защиту демократии, прав человека, против милитаризма.
С 1990 года стал активно писать в интернете, а с 1997 года создал собственный сайт..
В 1993-2015 годах вел радиопрограммы о христианстве. С 2016 года стал вести свой ютьюб-канал.
Женат, есть дети, внучки, внуки.
В 1974 году был крещен. Священник Богородской епархии Православной Церкви Украины Константинопольского патриархата, богослужения совершает у себя дома в Москве.